万方本科论文查重前后对比，主要差异体现在查重结果的相似度和重复率上。在查重前，学生需要自行对论文进行查重，发现重复率高的部分并进行修改；而在查重后，系统会给出具体的重复率数据，让学生更清晰地了解自身论文的原创性。此外，查重前后还可以发现论文中可能存在的抄袭问题，帮助学生及时进行整改，提高论文质量。

另外，万方本科论文查重前后对比还体现在学术规范性和知识产权保护上。查重前，学生可能并不清楚自己论文中的抄袭问题，容易出现学术不端现象；而查重后，学生可以更加规范地撰写论文，保护知识产权，避免侵权行为。因此，万方本科论文查重前后对比，不仅仅是技术工具的使用，更是对学术诚信和知识产权的重视。